Обитаемый орбитальный отсек (ОО) – масса 1,2 – 1,3 т, диаметр 2,2 м, длина со стыковочным агрегатом 3,44 м, объем по внутренним обводам герметичного корпуса 6,6 м³, свободный объем 4 м³ - используется в качестве рабочего отсека при проведении научных экспериментов, для отдыха экипажа, перехода его в другой КК и для выхода в космическое пространство (выполняет роль шлюзовой камеры). Герметичный корпус ОО, выполненный из магниевого сплава, представляет собой две полусферические оболочки диаметром 2,2 м, соединенные цилиндрической вставкой высотой 0,3 м. Отсек имеет два обзорных иллюминатора. В корпусе расположены два люка, один из которых соединяет ОО с СА, а другой (диаметр «в свету» 0,64 м) служит для посадки экипажа в КК на стартовой позиции и для выхода в космос. В ОО расположены пульт управления, приборы и агрегаты основных и вспомогательных систем КК, бытовое оборудование, научная аппаратура. При отработке и обеспечении стыковки автоматических и пилотируемых модификаций КК в случае использования их в качестве транспортных кораблей в верхней части ОО устанавливается стыковочный агрегат, выполняющий следующие функции: поглощение (демпфирование) энергии соударения КК; первичную сцепку; выравнивание и стягивание КК; жесткое соединение конструкций кораблей (начиная с «Союз-10» - с созданием герметичного стыка между ними); расстыковку и разделение КК. В КК «Союз» нашли применение три типа стыковочных устройств: первый, выполненный по схеме «штырь-конус»; второй, также выполненный по этой схеме, но с созданием герметичного стыка между состыкованными КК для обеспечения перехода экипажа из одного КК в другой; третий (в эксперименте по программе ЭПАС), представляющий собой новое, технически более совершенное устройство – андрогинный периферийный агрегат стыковки (АПАС). Конструктивно стыковочное устройство первых двух типов состоит из двух частей: активного стыковочного агрегата, устанавливаемого на одном из КК и снабженного механизмом для осуществления всех действий по стыковке, и пассивного стыковочного агрегата, устанавливаемого на другом КК. Каждая часть стыковочного устройства выполнена в виде 2 автономных узлов – стыковочного механизма (на активном агрегате) и его ответной части (на пассивном агрегате); стыковочного шпангоута с расположенными на нем дополнительными механизмами. Стыковочный механизм на активном агрегате выполняет основные функции по соединению КК до соприкосновения стыковочных шпангоутов. Ответная, пассивная часть представляет собой приемный конус, в который при стыковке входит штырь стыковочного механизма.